نمازگزاران حتی اجازه شروع سخنرانی را به وی نداده و با شعارهایی از جمله مرگ بر ضد ولایت فقیه . مرگ بر موسوی . ما اهل کوفه نیستیم علی تنها بماند . بصیرت حاج احمد هدیه به بستگانش و ... یصدا فریاد می کشیدند.
این شعارها به حدی سنگین و رسا بود که شبکه های سیما مجبور به قطع مکرر صدا شده و حتی سید حسن خمینی بارها سکوت کرده و از جمعیت می خواست اجازه صحبت به او بدهند که مردم یکصدا شعار مرگ بر ضد ولایت فقیه را سر می دادند.
سیدحسن خمینی در مواجهه با جمعیت كمنظیر مردم كه شعار "ما اهل كوفه نیستیم، علی تنها بماند " سرمیدادند تأكید كرد: قطعاً همینطور است.
سیدحسن خمینی كه به دلیل شعارهای گسترده مردم نمیتوانست آنگونه كه میخواهد سخنرانی كند، گفت: اگر دوستان بنای شعار دارند، بهتر است اجازه دهند من چند دقیقهای صحبت كنم، وقتی كه رهبری معظم انقلاب تشریف آوردند و در جایگاه قرار گرفتند، طبیعتاً نسبت به آن بزگوار ابراز احساسات میكنند
.
سیدحسن خمینی كه به دلیل شعارهای گسترده مردم علیه فتنهگران و اعتراض به سكوت وی در برابر اقدامات فتنهگران علیه آرمانهای امام خمینی(ره) اعم از ولایت فقیه و قدس و ... نمیتوانست به سخنرانی خود ادامه دهد، با ناراحتی خطاب به مردم گفت كه هنوز 20 سال از رحلت امام(ره) نگذشته است
.
وی برای آرام كردن مردم و جلوگیری از شعار دادن آنها، سه بار خواستار ذكر صلوات از سوی حاضرین در مراسم شد ولی مردم از سر دادن شعار علیه سران فتنه دست بردار نبودند.سید حسن خمینی در ادامه گفت كه انشاالله عزاداری مقبول باشد.
سیدحسن خمینی در حالیكه همه مردم یك صدا و یكپارچه در داخل و بیرون حرم علیه فتنهگران شعار میدادند، گفت: مردم از گروه اندكی كه شلوغ میكنند، بیزارند و مردمی كه بیرون صحن حضور دارند، علاقمند به امام خمینی(ره) هستند.
وی سپس افزود: اجازه بدهید چند دقیقه صحبت كنم، چراكه شأن مراسم سالگرد امام(ره) چنین نیست كه برخی اندك اینچنین انجام میدهند.
پس از شروع سخنان رهبر معظم انقلاب سید حسن خمینی در حالی که ناراحتی در چهره او کاملا نمایان بود در کنار هاشمی رفسنجانی در جایگاه مسئولین قرار گرفت.